Los jueces son asignados bajo el Servicio Civil de Carrera, que es la comisión que se encarga de llevar al cabo los concursos y exámenes de oposición para ocupar los cargos de juez.
Sus bases se encuentran en los artículos 23, 24, 25, 28, 69, 70, 71, 72, 73, y 74 de la Ley orgánica del Tribunal de lo Contencioso Administrativo del Estado de Querétaro
La designación del Magistrado Propietario, se lleva al cabo en atención al Artículo 17, Fracción IV de la Constitución Política del Estado de Querétaro y se hace bajo los artículos 11 fracción XX, 12, 13, 14 y 70 de la Ley orgánica del Tribunal de lo Contencioso Administrativo del Estado de Querétaro
Nombramiento de la Magistrada Propietaria Primera Sección
Nombramiento del Magistrado Propietario Segunda Sección
Nombramiento del Magistrado Propietario Tercera Sección